Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA2D1P54289 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms