Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms