Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCN3P51790 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCN3P51790 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCN3P51790 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCN3P51790 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCN3P51790 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCN3P51790 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCN3P51790 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCN3P51790 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCN3P51790 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCN3P51790 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCN3P51790 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCN3P51790 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCN3P51790 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCN3P51790 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms