Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNA2P51530 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNA2P51530 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNA2P51530 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNA2P51530 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNA2P51530 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNA2P51530 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNA2P51530 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNA2P51530 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNA2P51530 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNA2P51530 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNA2P51530 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNA2P51530 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNA2P51530 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNA2P51530 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNA2P51530 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNA2P51530 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNA2P51530 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNA2P51530 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNA2P51530 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNA2P51530 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNA2P51530 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNA2P51530 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNA2P51530 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNA2P51530 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNA2P51530 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNA2P51530 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNA2P51530 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNA2P51530 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNA2P51530 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNA2P51530 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNA2P51530 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNA2P51530 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNA2P51530 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNA2P51530 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNA2P51530 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNA2P51530 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNA2P51530 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNA2P51530 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNA2P51530 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms