Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF4P48230 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF4P48230 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms