Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCC3P46736 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms