Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RANGAP1P46060 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RANGAP1P46060 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RANGAP1P46060 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RANGAP1P46060 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RANGAP1P46060 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RANGAP1P46060 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RANGAP1P46060 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RANGAP1P46060 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.78■■■■□ 3
RANGAP1P46060 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
RANGAP1P46060 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.78■■■■□ 3
RANGAP1P46060 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RANGAP1P46060 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RANGAP1P46060 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.77■■■■□ 3
RANGAP1P46060 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RANGAP1P46060 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RANGAP1P46060 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RANGAP1P46060 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RANGAP1P46060 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RANGAP1P46060 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
RANGAP1P46060 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RANGAP1P46060 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
RANGAP1P46060 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RANGAP1P46060 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RANGAP1P46060 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms