Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PBX2P40425 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PBX2P40425 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX2P40425 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX2P40425 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX2P40425 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX2P40425 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX2P40425 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX2P40425 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PBX2P40425 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX2P40425 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX2P40425 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX2P40425 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX2P40425 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX2P40425 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX2P40425 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX2P40425 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX2P40425 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX2P40425 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX2P40425 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX2P40425 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX2P40425 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX2P40425 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX2P40425 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX2P40425 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX2P40425 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX2P40425 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX2P40425 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX2P40425 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX2P40425 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX2P40425 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX2P40425 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PBX2P40425 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX2P40425 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX2P40425 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms