Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HSPA9P38646 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPA9P38646 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms