Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CPS1P31327 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CPS1P31327 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CPS1P31327 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CPS1P31327 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CPS1P31327 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CPS1P31327 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CPS1P31327 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPS1P31327 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPS1P31327 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPS1P31327 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPS1P31327 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPS1P31327 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPS1P31327 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPS1P31327 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPS1P31327 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPS1P31327 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CPS1P31327 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPS1P31327 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPS1P31327 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPS1P31327 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPS1P31327 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPS1P31327 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPS1P31327 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPS1P31327 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPS1P31327 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CPS1P31327 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPS1P31327 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CPS1P31327 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CPS1P31327 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CPS1P31327 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CPS1P31327 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CPS1P31327 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CPS1P31327 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CPS1P31327 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CPS1P31327 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CPS1P31327 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CPS1P31327 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPS1P31327 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPS1P31327 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPS1P31327 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPS1P31327 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPS1P31327 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPS1P31327 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CPS1P31327 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPS1P31327 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPS1P31327 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPS1P31327 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPS1P31327 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CPS1P31327 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPS1P31327 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPS1P31327 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPS1P31327 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPS1P31327 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPS1P31327 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPS1P31327 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPS1P31327 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPS1P31327 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPS1P31327 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPS1P31327 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPS1P31327 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CPS1P31327 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CPS1P31327 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CPS1P31327 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CPS1P31327 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CPS1P31327 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CPS1P31327 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CPS1P31327 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms