Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPIFP30405 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPIFP30405 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPIFP30405 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPIFP30405 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPIFP30405 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPIFP30405 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPIFP30405 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPIFP30405 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPIFP30405 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPIFP30405 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPIFP30405 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPIFP30405 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPIFP30405 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPIFP30405 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPIFP30405 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms