Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK1P29120 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK1P29120 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms