Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK3P27448 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK3P27448 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK3P27448 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK3P27448 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK3P27448 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK3P27448 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK3P27448 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK3P27448 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK3P27448 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK3P27448 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK3P27448 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK3P27448 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARK3P27448 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARK3P27448 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARK3P27448 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARK3P27448 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARK3P27448 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARK3P27448 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARK3P27448 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARK3P27448 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARK3P27448 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARK3P27448 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MARK3P27448 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARK3P27448 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARK3P27448 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARK3P27448 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARK3P27448 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARK3P27448 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms