Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMLP26374 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMLP26374 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMLP26374 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMLP26374 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMLP26374 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMLP26374 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMLP26374 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMLP26374 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMLP26374 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMLP26374 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMLP26374 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMLP26374 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMLP26374 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMLP26374 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMLP26374 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMLP26374 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMLP26374 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMLP26374 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMLP26374 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMLP26374 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMLP26374 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMLP26374 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMLP26374 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMLP26374 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMLP26374 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMLP26374 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms