Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF3P18847 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF3P18847 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF3P18847 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF3P18847 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF3P18847 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF3P18847 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF3P18847 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF3P18847 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF3P18847 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF3P18847 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF3P18847 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF3P18847 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF3P18847 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF3P18847 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF3P18847 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF3P18847 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF3P18847 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF3P18847 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF3P18847 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF3P18847 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF3P18847 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF3P18847 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF3P18847 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF3P18847 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF3P18847 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF3P18847 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF3P18847 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF3P18847 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF3P18847 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF3P18847 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATF3P18847 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATF3P18847 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATF3P18847 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATF3P18847 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF3P18847 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF3P18847 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF3P18847 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF3P18847 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF3P18847 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF3P18847 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF3P18847 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF3P18847 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF3P18847 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF3P18847 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF3P18847 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF3P18847 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF3P18847 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF3P18847 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF3P18847 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF3P18847 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF3P18847 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF3P18847 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF3P18847 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF3P18847 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF3P18847 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF3P18847 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF3P18847 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF3P18847 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF3P18847 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF3P18847 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF3P18847 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF3P18847 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF3P18847 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF3P18847 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF3P18847 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms