Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN2P17655 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN2P17655 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms