Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB8P17481 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms