Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC130P13994 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms