Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms