Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TOP2AP11388 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms