Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP1P11387 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP1P11387 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOP1P11387 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOP1P11387 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOP1P11387 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1P11387 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1P11387 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1P11387 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1P11387 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1P11387 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1P11387 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1P11387 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1P11387 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1P11387 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1P11387 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1P11387 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1P11387 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1P11387 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1P11387 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1P11387 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1P11387 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1P11387 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1P11387 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms