Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CD8BP10966 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD8BP10966 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD8BP10966 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD8BP10966 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD8BP10966 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD8BP10966 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD8BP10966 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD8BP10966 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD8BP10966 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD8BP10966 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD8BP10966 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CD8BP10966 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms