Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf88P0DMB2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms