Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC166P0CW27 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC166P0CW27 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms