Protein–RNA interactions for Protein: P00558

PGK1, Phosphoglycerate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGK1P00558 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK1P00558 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK1P00558 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK1P00558 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK1P00558 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK1P00558 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK1P00558 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK1P00558 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK1P00558 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGK1P00558 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGK1P00558 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGK1P00558 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK1P00558 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK1P00558 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK1P00558 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK1P00558 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK1P00558 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK1P00558 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK1P00558 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK1P00558 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK1P00558 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK1P00558 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK1P00558 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK1P00558 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK1P00558 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK1P00558 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK1P00558 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK1P00558 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK1P00558 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK1P00558 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK1P00558 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK1P00558 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK1P00558 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK1P00558 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK1P00558 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK1P00558 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms