Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFRP00533 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFRP00533 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFRP00533 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFRP00533 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFRP00533 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFRP00533 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFRP00533 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFRP00533 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFRP00533 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EGFRP00533 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EGFRP00533 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EGFRP00533 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EGFRP00533 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EGFRP00533 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EGFRP00533 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EGFRP00533 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EGFRP00533 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EGFRP00533 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EGFRP00533 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EGFRP00533 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EGFRP00533 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EGFRP00533 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EGFRP00533 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EGFRP00533 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EGFRP00533 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EGFRP00533 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EGFRP00533 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EGFRP00533 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EGFRP00533 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EGFRP00533 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EGFRP00533 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EGFRP00533 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EGFRP00533 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EGFRP00533 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EGFRP00533 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EGFRP00533 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms