Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSDE1O75534 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms