Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF3O75054 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms