Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC42.26■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
ABCC9O60706 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
ABCC9O60706 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms