Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUPR1O60356 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms