Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KIAA0556O60303 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KIAA0556O60303 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms