Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PODXLO00592 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PODXLO00592 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PODXLO00592 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXLO00592 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXLO00592 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXLO00592 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXLO00592 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXLO00592 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXLO00592 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXLO00592 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXLO00592 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms