Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCER2I3L3R5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCER2I3L3R5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCER2I3L3R5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms