Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
H3BQV1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
H3BQV1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
H3BQV1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
H3BQV1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
H3BQV1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
H3BQV1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
H3BQV1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
H3BQV1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BQV1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BQV1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BQV1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BQV1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BQV1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BQV1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BQV1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BQV1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BQV1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BQV1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BQV1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BQV1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BQV1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BQV1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BQV1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BQV1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BQV1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BQV1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BQV1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BQV1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BQV1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BQV1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BQV1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BQV1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BQV1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BQV1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BQV1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BQV1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BQV1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BQV1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BQV1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BQV1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BQV1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BQV1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms