Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms