Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM3A6NDB9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM3A6NDB9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms