Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM89A2RUT3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM89A2RUT3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms