Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Top3bQ9Z321 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Top3bQ9Z321 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Top3bQ9Z321 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Top3bQ9Z321 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Top3bQ9Z321 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Top3bQ9Z321 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Top3bQ9Z321 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Top3bQ9Z321 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Top3bQ9Z321 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Top3bQ9Z321 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Top3bQ9Z321 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Top3bQ9Z321 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Top3bQ9Z321 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Top3bQ9Z321 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Top3bQ9Z321 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Top3bQ9Z321 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,7■■□□□ 1,71
Top3bQ9Z321 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Top3bQ9Z321 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Top3bQ9Z321 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Top3bQ9Z321 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Top3bQ9Z321 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Top3bQ9Z321 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Top3bQ9Z321 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Top3bQ9Z321 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Top3bQ9Z321 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Top3bQ9Z321 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Top3bQ9Z321 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Top3bQ9Z321 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Top3bQ9Z321 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Top3bQ9Z321 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Top3bQ9Z321 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Top3bQ9Z321 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Top3bQ9Z321 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Top3bQ9Z321 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Top3bQ9Z321 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Top3bQ9Z321 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Top3bQ9Z321 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Top3bQ9Z321 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Top3bQ9Z321 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Top3bQ9Z321 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Top3bQ9Z321 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Top3bQ9Z321 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Top3bQ9Z321 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Top3bQ9Z321 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Top3bQ9Z321 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Top3bQ9Z321 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Top3bQ9Z321 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Top3bQ9Z321 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Top3bQ9Z321 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Top3bQ9Z321 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Top3bQ9Z321 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Top3bQ9Z321 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Top3bQ9Z321 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Top3bQ9Z321 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53,7 ms