Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ap3b1Q9Z1T1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Ap3b1Q9Z1T1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ap3b1Q9Z1T1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Ap3b1Q9Z1T1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Ap3b1Q9Z1T1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ap3b1Q9Z1T1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ap3b1Q9Z1T1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ap3b1Q9Z1T1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ap3b1Q9Z1T1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ap3b1Q9Z1T1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ap3b1Q9Z1T1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Ap3b1Q9Z1T1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Ap3b1Q9Z1T1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Ap3b1Q9Z1T1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ap3b1Q9Z1T1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ap3b1Q9Z1T1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ap3b1Q9Z1T1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ap3b1Q9Z1T1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ap3b1Q9Z1T1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ap3b1Q9Z1T1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ap3b1Q9Z1T1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ap3b1Q9Z1T1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ap3b1Q9Z1T1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ap3b1Q9Z1T1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ap3b1Q9Z1T1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ap3b1Q9Z1T1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ap3b1Q9Z1T1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ap3b1Q9Z1T1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ap3b1Q9Z1T1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ap3b1Q9Z1T1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ap3b1Q9Z1T1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ap3b1Q9Z1T1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ap3b1Q9Z1T1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ap3b1Q9Z1T1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ap3b1Q9Z1T1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ap3b1Q9Z1T1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
Ap3b1Q9Z1T1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ap3b1Q9Z1T1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ap3b1Q9Z1T1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ap3b1Q9Z1T1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ap3b1Q9Z1T1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ap3b1Q9Z1T1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ap3b1Q9Z1T1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ap3b1Q9Z1T1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ap3b1Q9Z1T1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ap3b1Q9Z1T1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ap3b1Q9Z1T1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ap3b1Q9Z1T1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ap3b1Q9Z1T1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ap3b1Q9Z1T1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ap3b1Q9Z1T1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ap3b1Q9Z1T1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ap3b1Q9Z1T1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ap3b1Q9Z1T1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ap3b1Q9Z1T1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ap3b1Q9Z1T1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Ap3b1Q9Z1T1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ap3b1Q9Z1T1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ap3b1Q9Z1T1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ap3b1Q9Z1T1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ap3b1Q9Z1T1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ap3b1Q9Z1T1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ap3b1Q9Z1T1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Ap3b1Q9Z1T1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ap3b1Q9Z1T1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Ap3b1Q9Z1T1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ap3b1Q9Z1T1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ap3b1Q9Z1T1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ap3b1Q9Z1T1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ap3b1Q9Z1T1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms