Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PoleQ9WVF7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PoleQ9WVF7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PoleQ9WVF7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PoleQ9WVF7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PoleQ9WVF7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PoleQ9WVF7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PoleQ9WVF7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PoleQ9WVF7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PoleQ9WVF7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PoleQ9WVF7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PoleQ9WVF7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PoleQ9WVF7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PoleQ9WVF7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PoleQ9WVF7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PoleQ9WVF7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PoleQ9WVF7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PoleQ9WVF7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PoleQ9WVF7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PoleQ9WVF7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PoleQ9WVF7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PoleQ9WVF7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PoleQ9WVF7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PoleQ9WVF7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PoleQ9WVF7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PoleQ9WVF7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PoleQ9WVF7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PoleQ9WVF7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PoleQ9WVF7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PoleQ9WVF7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PoleQ9WVF7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PoleQ9WVF7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PoleQ9WVF7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PoleQ9WVF7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PoleQ9WVF7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PoleQ9WVF7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PoleQ9WVF7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PoleQ9WVF7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PoleQ9WVF7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms