Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1X5

Abcc5, Multidrug resistance-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc5Q9R1X5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc5Q9R1X5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc5Q9R1X5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc5Q9R1X5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Abcc5Q9R1X5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc5Q9R1X5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Abcc5Q9R1X5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Abcc5Q9R1X5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Abcc5Q9R1X5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc5Q9R1X5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc5Q9R1X5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc5Q9R1X5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc5Q9R1X5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc5Q9R1X5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc5Q9R1X5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc5Q9R1X5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc5Q9R1X5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc5Q9R1X5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc5Q9R1X5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc5Q9R1X5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc5Q9R1X5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Abcc5Q9R1X5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Abcc5Q9R1X5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Abcc5Q9R1X5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Abcc5Q9R1X5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc5Q9R1X5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc5Q9R1X5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Abcc5Q9R1X5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Abcc5Q9R1X5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Abcc5Q9R1X5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Abcc5Q9R1X5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abcc5Q9R1X5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abcc5Q9R1X5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc5Q9R1X5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abcc5Q9R1X5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abcc5Q9R1X5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc5Q9R1X5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc5Q9R1X5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abcc5Q9R1X5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abcc5Q9R1X5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Abcc5Q9R1X5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Abcc5Q9R1X5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Abcc5Q9R1X5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Abcc5Q9R1X5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Abcc5Q9R1X5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Abcc5Q9R1X5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc5Q9R1X5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abcc5Q9R1X5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Abcc5Q9R1X5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Abcc5Q9R1X5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Abcc5Q9R1X5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Abcc5Q9R1X5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc5Q9R1X5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abcc5Q9R1X5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc5Q9R1X5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Abcc5Q9R1X5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Abcc5Q9R1X5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Abcc5Q9R1X5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Abcc5Q9R1X5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Abcc5Q9R1X5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Abcc5Q9R1X5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Abcc5Q9R1X5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Abcc5Q9R1X5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Abcc5Q9R1X5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Abcc5Q9R1X5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Abcc5Q9R1X5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Abcc5Q9R1X5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Abcc5Q9R1X5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc5Q9R1X5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Abcc5Q9R1X5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Abcc5Q9R1X5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Abcc5Q9R1X5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Abcc5Q9R1X5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Abcc5Q9R1X5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abcc5Q9R1X5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Abcc5Q9R1X5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Abcc5Q9R1X5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Abcc5Q9R1X5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Abcc5Q9R1X5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Abcc5Q9R1X5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Abcc5Q9R1X5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc5Q9R1X5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Abcc5Q9R1X5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Abcc5Q9R1X5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Abcc5Q9R1X5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Abcc5Q9R1X5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Abcc5Q9R1X5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Abcc5Q9R1X5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Abcc5Q9R1X5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Abcc5Q9R1X5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Abcc5Q9R1X5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Abcc5Q9R1X5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abcc5Q9R1X5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abcc5Q9R1X5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abcc5Q9R1X5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Abcc5Q9R1X5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Abcc5Q9R1X5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Abcc5Q9R1X5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Abcc5Q9R1X5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Abcc5Q9R1X5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms