Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Zeb2Q9R0G7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Zeb2Q9R0G7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Zeb2Q9R0G7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Zeb2Q9R0G7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Zeb2Q9R0G7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Zeb2Q9R0G7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Zeb2Q9R0G7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Zeb2Q9R0G7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Zeb2Q9R0G7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Zeb2Q9R0G7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Zeb2Q9R0G7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Zeb2Q9R0G7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,25■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33,21■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Zeb2Q9R0G7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Zeb2Q9R0G7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Zeb2Q9R0G7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Zeb2Q9R0G7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Zeb2Q9R0G7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Zeb2Q9R0G7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Zeb2Q9R0G7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Zeb2Q9R0G7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Zeb2Q9R0G7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Zeb2Q9R0G7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Zeb2Q9R0G7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Zeb2Q9R0G7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Zeb2Q9R0G7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Zeb2Q9R0G7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Zeb2Q9R0G7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33,07■■■□□ 2,88
Zeb2Q9R0G7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Zeb2Q9R0G7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Zeb2Q9R0G7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Zeb2Q9R0G7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Zeb2Q9R0G7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Zeb2Q9R0G7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Zeb2Q9R0G7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Zeb2Q9R0G7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Zeb2Q9R0G7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Zeb2Q9R0G7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Zeb2Q9R0G7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Zeb2Q9R0G7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Zeb2Q9R0G7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Zeb2Q9R0G7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Zeb2Q9R0G7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32,93■■■□□ 2,86
Zeb2Q9R0G7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Zeb2Q9R0G7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Zeb2Q9R0G7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Zeb2Q9R0G7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Zeb2Q9R0G7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Zeb2Q9R0G7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Zeb2Q9R0G7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Zeb2Q9R0G7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32,89■■■□□ 2,86
Zeb2Q9R0G7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Zeb2Q9R0G7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Zeb2Q9R0G7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Zeb2Q9R0G7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Zeb2Q9R0G7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Zeb2Q9R0G7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Zeb2Q9R0G7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Zeb2Q9R0G7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Zeb2Q9R0G7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Zeb2Q9R0G7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Zeb2Q9R0G7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Zeb2Q9R0G7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32,82■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32,82■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32,8■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32,76■■■□□ 2,84
Zeb2Q9R0G7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32,76■■■□□ 2,83
Zeb2Q9R0G7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Zeb2Q9R0G7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Zeb2Q9R0G7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Zeb2Q9R0G7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Zeb2Q9R0G7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Zeb2Q9R0G7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Zeb2Q9R0G7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32,71■■■□□ 2,83
Zeb2Q9R0G7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Zeb2Q9R0G7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Zeb2Q9R0G7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms