Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prkab1Q9R078 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prkab1Q9R078 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prkab1Q9R078 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prkab1Q9R078 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prkab1Q9R078 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prkab1Q9R078 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prkab1Q9R078 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prkab1Q9R078 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prkab1Q9R078 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prkab1Q9R078 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prkab1Q9R078 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prkab1Q9R078 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prkab1Q9R078 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prkab1Q9R078 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prkab1Q9R078 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prkab1Q9R078 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prkab1Q9R078 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prkab1Q9R078 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prkab1Q9R078 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prkab1Q9R078 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prkab1Q9R078 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prkab1Q9R078 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkab1Q9R078 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Prkab1Q9R078 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prkab1Q9R078 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prkab1Q9R078 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prkab1Q9R078 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prkab1Q9R078 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prkab1Q9R078 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prkab1Q9R078 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prkab1Q9R078 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Prkab1Q9R078 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prkab1Q9R078 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prkab1Q9R078 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prkab1Q9R078 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prkab1Q9R078 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prkab1Q9R078 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prkab1Q9R078 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prkab1Q9R078 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prkab1Q9R078 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prkab1Q9R078 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prkab1Q9R078 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prkab1Q9R078 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Prkab1Q9R078 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prkab1Q9R078 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prkab1Q9R078 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prkab1Q9R078 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prkab1Q9R078 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prkab1Q9R078 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Prkab1Q9R078 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prkab1Q9R078 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prkab1Q9R078 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prkab1Q9R078 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prkab1Q9R078 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prkab1Q9R078 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prkab1Q9R078 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prkab1Q9R078 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prkab1Q9R078 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prkab1Q9R078 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prkab1Q9R078 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prkab1Q9R078 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prkab1Q9R078 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prkab1Q9R078 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prkab1Q9R078 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prkab1Q9R078 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prkab1Q9R078 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prkab1Q9R078 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prkab1Q9R078 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Prkab1Q9R078 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prkab1Q9R078 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prkab1Q9R078 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prkab1Q9R078 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prkab1Q9R078 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prkab1Q9R078 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prkab1Q9R078 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prkab1Q9R078 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prkab1Q9R078 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkab1Q9R078 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkab1Q9R078 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Prkab1Q9R078 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prkab1Q9R078 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prkab1Q9R078 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prkab1Q9R078 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prkab1Q9R078 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prkab1Q9R078 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prkab1Q9R078 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms