Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 TAF10-203ENST00000531760 502 ntTSL 517.12■□□□□ 0.333e-14■■■■■ 49.3
FAM120AQ9NZB2 TAF10-205ENST00000616342 5392 ntTSL 1 (best)13.72□□□□□ -0.213e-14■■■■■ 49.3
FAM120AQ9NZB2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 49.2
FAM120AQ9NZB2 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 49.2
FAM120AQ9NZB2 SNX12-205ENST00000490561 862 ntTSL 1 (best)13.79□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 49.2
FAM120AQ9NZB2 SNX12-207ENST00000622277 2422 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 49.2
FAM120AQ9NZB2 SNX12-204ENST00000483560 700 ntTSL 57.04□□□□□ -1.286e-7■■■■■ 49.2
FAM120AQ9NZB2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.377e-12■■■■■ 48.9
FAM120AQ9NZB2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.297e-12■■■■■ 48.9
FAM120AQ9NZB2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.197e-12■■■■■ 48.9
FAM120AQ9NZB2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.269e-7■■■■■ 48.9
FAM120AQ9NZB2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.562e-12■■■■■ 48.8
FAM120AQ9NZB2 CBL-205ENST00000637974 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 514□□□□□ -0.172e-12■■■■■ 48.8
FAM120AQ9NZB2 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.372e-12■■■■■ 48.8
FAM120AQ9NZB2 CBL-203ENST00000634586 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-12■■■■■ 48.8
FAM120AQ9NZB2 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)13.03□□□□□ -0.329e-8■■■■■ 48.8
FAM120AQ9NZB2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 48.7
FAM120AQ9NZB2 SPC24-203ENST00000585567 633 ntTSL 316.75■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 48.7
FAM120AQ9NZB2 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 59.91□□□□□ -0.821e-8■■■■■ 48.6
FAM120AQ9NZB2 SRP14-AS1-201ENST00000504245 2317 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 48.6
FAM120AQ9NZB2 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 48.6
FAM120AQ9NZB2 ZNF200-210ENST00000577015 637 ntTSL 419.64■□□□□ 0.739e-7■■■■■ 48.3
FAM120AQ9NZB2 ZNF200-207ENST00000575617 713 ntTSL 212.29□□□□□ -0.449e-7■■■■■ 48.3
FAM120AQ9NZB2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.393e-8■■■■■ 48.1
FAM120AQ9NZB2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 48.1
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.092e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-225ENST00000489897 998 ntTSL 520.83■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.872e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.822e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.822e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-230ENST00000530154 1670 ntTSL 219.19■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-217ENST00000372369 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-210ENST00000361746 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-229ENST00000528371 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-231ENST00000530581 893 ntTSL 1 (best)10.83□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-216ENST00000372368 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.782e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-214ENST00000372366 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-238ENST00000533997 1007 ntTSL 1 (best)9.89□□□□□ -0.832e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.832e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.832e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-222ENST00000469715 1160 ntTSL 1 (best)9.83□□□□□ -0.842e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-227ENST00000490541 976 ntTSL 1 (best)9.83□□□□□ -0.842e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-236ENST00000533212 781 ntTSL 1 (best)9.83□□□□□ -0.842e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.982e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.192e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.192e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-221ENST00000461375 806 ntTSL 57.33□□□□□ -1.242e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.422e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 MXI1-209ENST00000484030 838 ntTSL 57.53□□□□□ -1.23e-8■■■■■ 48
FAM120AQ9NZB2 ORMDL3-203ENST00000579287 349 ntTSL 313.01□□□□□ -0.331e-12■■■■■ 47.9
FAM120AQ9NZB2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 47.6
FAM120AQ9NZB2 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 47.6
FAM120AQ9NZB2 ZBTB18-202ENST00000622512 3740 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.968e-9■■■■■ 47.4
FAM120AQ9NZB2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.66e-11■■■■■ 47.3
FAM120AQ9NZB2 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.196e-11■■■■■ 47.3
FAM120AQ9NZB2 GYG2-203ENST00000381161 2852 ntTSL 212.69□□□□□ -0.386e-11■■■■■ 47.3
FAM120AQ9NZB2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.333e-13■■■■■ 47.2
FAM120AQ9NZB2 ZNF514-203ENST00000447814 554 ntTSL 49.12□□□□□ -0.953e-13■■■■■ 47.2
FAM120AQ9NZB2 TNXB-202ENST00000442721 372 ntTSL 1 (best)13.25□□□□□ -0.291e-10■■■■■ 47.2
FAM120AQ9NZB2 RNASEH1-202ENST00000436842 2120 ntTSL 222.47■■□□□ 1.194e-8■■■■■ 47.1
FAM120AQ9NZB2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.174e-8■■■■■ 47.1
FAM120AQ9NZB2 CD276-214ENST00000561260 628 ntTSL 316.48■□□□□ 0.232e-11■■■■■ 46.9
FAM120AQ9NZB2 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.234e-13■■■■■ 46.9
FAM120AQ9NZB2 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 46.9
FAM120AQ9NZB2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.942e-8■■■■■ 46.8
FAM120AQ9NZB2 MXI1-207ENST00000453116 803 ntTSL 526.68■■□□□ 1.862e-8■■■■■ 46.8
FAM120AQ9NZB2 MXI1-208ENST00000460667 782 ntTSL 325.86■■□□□ 1.732e-8■■■■■ 46.8
FAM120AQ9NZB2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 46.8
FAM120AQ9NZB2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 46.8
FAM120AQ9NZB2 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.092e-8■■■■■ 46.8
FAM120AQ9NZB2 LINC00894-204ENST00000444489 2951 ntTSL 512.04□□□□□ -0.485e-8■■■■■ 46.7
FAM120AQ9NZB2 VGLL4-205ENST00000417466 894 ntTSL 324.7■■□□□ 1.541e-9■■■■■ 46.7
FAM120AQ9NZB2 VGLL4-218ENST00000623028 728 ntTSL 520.15■□□□□ 0.821e-9■■■■■ 46.7
FAM120AQ9NZB2 VGLL4-212ENST00000437722 544 ntTSL 316.92■□□□□ 0.31e-9■■■■■ 46.7
FAM120AQ9NZB2 VGLL4-209ENST00000424709 437 ntTSL 315.97■□□□□ 0.151e-9■■■■■ 46.7
FAM120AQ9NZB2 VGLL4-207ENST00000419541 466 ntTSL 315.12■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 46.7
FAM120AQ9NZB2 VGLL4-217ENST00000480288 586 ntTSL 410.26□□□□□ -0.771e-9■■■■■ 46.7
FAM120AQ9NZB2 PHF5A-202ENST00000459687 504 ntTSL 36.06□□□□□ -1.442e-13■■■■■ 46.6
FAM120AQ9NZB2 PDXK-215ENST00000476313 1704 ntTSL 321.17■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 46.5
FAM120AQ9NZB2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 46.5
FAM120AQ9NZB2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 46.5
FAM120AQ9NZB2 RGL3-216ENST00000569439 973 ntTSL 221.71■■□□□ 1.072e-13■■■■■ 46.5
FAM120AQ9NZB2 RGL3-214ENST00000568420 771 ntTSL 321.63■■□□□ 1.052e-13■■■■■ 46.5
FAM120AQ9NZB2 RGL3-203ENST00000453604 1455 ntTSL 220.32■□□□□ 0.842e-13■■■■■ 46.5
FAM120AQ9NZB2 RGL3-206ENST00000562663 2303 ntTSL 519.51■□□□□ 0.712e-13■■■■■ 46.5
FAM120AQ9NZB2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-13■■■■■ 46.5
FAM120AQ9NZB2 RGL3-208ENST00000563726 2366 ntTSL 219.25■□□□□ 0.672e-13■■■■■ 46.5
FAM120AQ9NZB2 RGL3-204ENST00000561570 504 ntTSL 418.83■□□□□ 0.62e-13■■■■■ 46.5
FAM120AQ9NZB2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-13■■■■■ 46.5
FAM120AQ9NZB2 RGL3-212ENST00000567080 537 ntTSL 417.32■□□□□ 0.362e-13■■■■■ 46.5
Retrieved 100 of 20,049 protein–RNA pairs in 76 ms