Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLZ8

Sigirr, Single Ig IL-1-related receptor, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SigirrQ9JLZ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SigirrQ9JLZ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SigirrQ9JLZ8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SigirrQ9JLZ8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SigirrQ9JLZ8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SigirrQ9JLZ8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SigirrQ9JLZ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SigirrQ9JLZ8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SigirrQ9JLZ8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SigirrQ9JLZ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SigirrQ9JLZ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SigirrQ9JLZ8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SigirrQ9JLZ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SigirrQ9JLZ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SigirrQ9JLZ8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SigirrQ9JLZ8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SigirrQ9JLZ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SigirrQ9JLZ8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SigirrQ9JLZ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SigirrQ9JLZ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SigirrQ9JLZ8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SigirrQ9JLZ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SigirrQ9JLZ8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SigirrQ9JLZ8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SigirrQ9JLZ8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SigirrQ9JLZ8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SigirrQ9JLZ8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SigirrQ9JLZ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SigirrQ9JLZ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SigirrQ9JLZ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SigirrQ9JLZ8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SigirrQ9JLZ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SigirrQ9JLZ8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SigirrQ9JLZ8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SigirrQ9JLZ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SigirrQ9JLZ8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SigirrQ9JLZ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SigirrQ9JLZ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SigirrQ9JLZ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SigirrQ9JLZ8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SigirrQ9JLZ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SigirrQ9JLZ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SigirrQ9JLZ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SigirrQ9JLZ8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SigirrQ9JLZ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SigirrQ9JLZ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SigirrQ9JLZ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SigirrQ9JLZ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SigirrQ9JLZ8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SigirrQ9JLZ8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SigirrQ9JLZ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SigirrQ9JLZ8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SigirrQ9JLZ8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SigirrQ9JLZ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SigirrQ9JLZ8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SigirrQ9JLZ8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms