Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL0

Crim1, Cysteine-rich motor neuron 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crim1Q9JLL0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Crim1Q9JLL0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Crim1Q9JLL0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Crim1Q9JLL0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Crim1Q9JLL0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crim1Q9JLL0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crim1Q9JLL0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crim1Q9JLL0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crim1Q9JLL0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crim1Q9JLL0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crim1Q9JLL0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crim1Q9JLL0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Crim1Q9JLL0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crim1Q9JLL0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crim1Q9JLL0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crim1Q9JLL0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crim1Q9JLL0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crim1Q9JLL0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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