Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC9

Herpud2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud2Q9JJC9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Herpud2Q9JJC9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Herpud2Q9JJC9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Herpud2Q9JJC9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Herpud2Q9JJC9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Herpud2Q9JJC9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Herpud2Q9JJC9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Herpud2Q9JJC9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Herpud2Q9JJC9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Herpud2Q9JJC9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Herpud2Q9JJC9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Herpud2Q9JJC9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Herpud2Q9JJC9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Herpud2Q9JJC9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Herpud2Q9JJC9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Herpud2Q9JJC9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Herpud2Q9JJC9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Herpud2Q9JJC9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Herpud2Q9JJC9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Herpud2Q9JJC9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Herpud2Q9JJC9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Herpud2Q9JJC9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Herpud2Q9JJC9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Herpud2Q9JJC9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Herpud2Q9JJC9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Herpud2Q9JJC9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Herpud2Q9JJC9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Herpud2Q9JJC9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Herpud2Q9JJC9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Herpud2Q9JJC9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Herpud2Q9JJC9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Herpud2Q9JJC9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Herpud2Q9JJC9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Herpud2Q9JJC9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Herpud2Q9JJC9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Herpud2Q9JJC9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herpud2Q9JJC9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herpud2Q9JJC9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herpud2Q9JJC9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herpud2Q9JJC9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Herpud2Q9JJC9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Herpud2Q9JJC9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Herpud2Q9JJC9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Herpud2Q9JJC9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Herpud2Q9JJC9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Herpud2Q9JJC9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Herpud2Q9JJC9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Herpud2Q9JJC9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Herpud2Q9JJC9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Herpud2Q9JJC9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Herpud2Q9JJC9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Herpud2Q9JJC9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Herpud2Q9JJC9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Herpud2Q9JJC9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Herpud2Q9JJC9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herpud2Q9JJC9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herpud2Q9JJC9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Herpud2Q9JJC9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Herpud2Q9JJC9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Herpud2Q9JJC9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Herpud2Q9JJC9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Herpud2Q9JJC9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Herpud2Q9JJC9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Herpud2Q9JJC9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Herpud2Q9JJC9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Herpud2Q9JJC9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Herpud2Q9JJC9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Herpud2Q9JJC9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Herpud2Q9JJC9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herpud2Q9JJC9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herpud2Q9JJC9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herpud2Q9JJC9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herpud2Q9JJC9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Herpud2Q9JJC9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Herpud2Q9JJC9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Herpud2Q9JJC9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herpud2Q9JJC9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herpud2Q9JJC9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herpud2Q9JJC9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herpud2Q9JJC9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herpud2Q9JJC9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herpud2Q9JJC9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Herpud2Q9JJC9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Herpud2Q9JJC9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Herpud2Q9JJC9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Herpud2Q9JJC9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms