Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA7

Sphk2, Sphingosine kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk2Q9JIA7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sphk2Q9JIA7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sphk2Q9JIA7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sphk2Q9JIA7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sphk2Q9JIA7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sphk2Q9JIA7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sphk2Q9JIA7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sphk2Q9JIA7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sphk2Q9JIA7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sphk2Q9JIA7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sphk2Q9JIA7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sphk2Q9JIA7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sphk2Q9JIA7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sphk2Q9JIA7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sphk2Q9JIA7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sphk2Q9JIA7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sphk2Q9JIA7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sphk2Q9JIA7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sphk2Q9JIA7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sphk2Q9JIA7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sphk2Q9JIA7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sphk2Q9JIA7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sphk2Q9JIA7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sphk2Q9JIA7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sphk2Q9JIA7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sphk2Q9JIA7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sphk2Q9JIA7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sphk2Q9JIA7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sphk2Q9JIA7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sphk2Q9JIA7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sphk2Q9JIA7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sphk2Q9JIA7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sphk2Q9JIA7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sphk2Q9JIA7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sphk2Q9JIA7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sphk2Q9JIA7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sphk2Q9JIA7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sphk2Q9JIA7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sphk2Q9JIA7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sphk2Q9JIA7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sphk2Q9JIA7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sphk2Q9JIA7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sphk2Q9JIA7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sphk2Q9JIA7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sphk2Q9JIA7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sphk2Q9JIA7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sphk2Q9JIA7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sphk2Q9JIA7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sphk2Q9JIA7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sphk2Q9JIA7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sphk2Q9JIA7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sphk2Q9JIA7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sphk2Q9JIA7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sphk2Q9JIA7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sphk2Q9JIA7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sphk2Q9JIA7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sphk2Q9JIA7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sphk2Q9JIA7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sphk2Q9JIA7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sphk2Q9JIA7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sphk2Q9JIA7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sphk2Q9JIA7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sphk2Q9JIA7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sphk2Q9JIA7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sphk2Q9JIA7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sphk2Q9JIA7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sphk2Q9JIA7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sphk2Q9JIA7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sphk2Q9JIA7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sphk2Q9JIA7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.4 ms