Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERQ3

Znf704, Zinc finger protein 704, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf704Q9ERQ3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf704Q9ERQ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf704Q9ERQ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf704Q9ERQ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf704Q9ERQ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf704Q9ERQ3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf704Q9ERQ3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf704Q9ERQ3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf704Q9ERQ3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf704Q9ERQ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf704Q9ERQ3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf704Q9ERQ3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf704Q9ERQ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf704Q9ERQ3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf704Q9ERQ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf704Q9ERQ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf704Q9ERQ3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf704Q9ERQ3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf704Q9ERQ3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf704Q9ERQ3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf704Q9ERQ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf704Q9ERQ3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf704Q9ERQ3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf704Q9ERQ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf704Q9ERQ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf704Q9ERQ3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf704Q9ERQ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf704Q9ERQ3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf704Q9ERQ3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf704Q9ERQ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf704Q9ERQ3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf704Q9ERQ3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf704Q9ERQ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf704Q9ERQ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf704Q9ERQ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf704Q9ERQ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf704Q9ERQ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf704Q9ERQ3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Znf704Q9ERQ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Znf704Q9ERQ3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Znf704Q9ERQ3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf704Q9ERQ3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf704Q9ERQ3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf704Q9ERQ3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Znf704Q9ERQ3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf704Q9ERQ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Znf704Q9ERQ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Znf704Q9ERQ3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Znf704Q9ERQ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Znf704Q9ERQ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Znf704Q9ERQ3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Znf704Q9ERQ3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Znf704Q9ERQ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Znf704Q9ERQ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf704Q9ERQ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf704Q9ERQ3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Znf704Q9ERQ3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Znf704Q9ERQ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Znf704Q9ERQ3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Znf704Q9ERQ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf704Q9ERQ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf704Q9ERQ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf704Q9ERQ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf704Q9ERQ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Znf704Q9ERQ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Znf704Q9ERQ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf704Q9ERQ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf704Q9ERQ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf704Q9ERQ3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf704Q9ERQ3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf704Q9ERQ3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf704Q9ERQ3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf704Q9ERQ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf704Q9ERQ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf704Q9ERQ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf704Q9ERQ3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Znf704Q9ERQ3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Znf704Q9ERQ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Znf704Q9ERQ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Znf704Q9ERQ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Znf704Q9ERQ3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Znf704Q9ERQ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms