Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9E0

Slc22a17, Solute carrier family 22 member 17, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a17Q9D9E0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc22a17Q9D9E0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc22a17Q9D9E0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc22a17Q9D9E0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc22a17Q9D9E0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc22a17Q9D9E0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc22a17Q9D9E0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc22a17Q9D9E0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc22a17Q9D9E0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc22a17Q9D9E0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc22a17Q9D9E0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc22a17Q9D9E0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc22a17Q9D9E0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc22a17Q9D9E0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc22a17Q9D9E0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc22a17Q9D9E0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc22a17Q9D9E0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc22a17Q9D9E0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc22a17Q9D9E0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc22a17Q9D9E0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc22a17Q9D9E0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc22a17Q9D9E0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc22a17Q9D9E0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc22a17Q9D9E0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc22a17Q9D9E0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc22a17Q9D9E0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slc22a17Q9D9E0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc22a17Q9D9E0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc22a17Q9D9E0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc22a17Q9D9E0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc22a17Q9D9E0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc22a17Q9D9E0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc22a17Q9D9E0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc22a17Q9D9E0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc22a17Q9D9E0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc22a17Q9D9E0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc22a17Q9D9E0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc22a17Q9D9E0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc22a17Q9D9E0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slc22a17Q9D9E0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc22a17Q9D9E0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc22a17Q9D9E0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc22a17Q9D9E0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc22a17Q9D9E0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc22a17Q9D9E0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc22a17Q9D9E0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc22a17Q9D9E0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc22a17Q9D9E0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc22a17Q9D9E0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc22a17Q9D9E0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc22a17Q9D9E0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc22a17Q9D9E0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc22a17Q9D9E0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc22a17Q9D9E0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc22a17Q9D9E0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc22a17Q9D9E0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc22a17Q9D9E0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc22a17Q9D9E0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc22a17Q9D9E0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc22a17Q9D9E0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc22a17Q9D9E0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc22a17Q9D9E0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc22a17Q9D9E0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc22a17Q9D9E0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc22a17Q9D9E0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc22a17Q9D9E0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc22a17Q9D9E0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc22a17Q9D9E0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc22a17Q9D9E0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc22a17Q9D9E0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc22a17Q9D9E0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc22a17Q9D9E0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc22a17Q9D9E0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc22a17Q9D9E0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc22a17Q9D9E0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc22a17Q9D9E0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc22a17Q9D9E0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc22a17Q9D9E0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc22a17Q9D9E0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc22a17Q9D9E0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc22a17Q9D9E0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc22a17Q9D9E0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slc22a17Q9D9E0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc22a17Q9D9E0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc22a17Q9D9E0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc22a17Q9D9E0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc22a17Q9D9E0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms